第 31 章 贝叶斯模型

shinystan 借助 rstan 打包了一些 stan 编写的统计模型,提供模型评估的功能。相比于 rstanbrms 支持了更加广泛的模型,shinybrms 类似 shinystan 提供可视化的 shiny 前端,方便用户调用模型和评估效果。rstanarm 基于 stan 语言重写了 arm 里的模型,和 brms 一样,提供类似 lme4 的公式语法,和 Base R 内置的函数 lm()glm() 保持一致,降低用户学习成本。

cmdstanr 相比于 rstan 将会更加轻量,更快地将 CmdStan 的新功能融入进来,方便用户滚动升级,相比于 rstan 包,cmdstanr 包的一个巨大优势是和 Stan 软件的更新分离。做贝叶斯计算的软件框架还包括 JAGS 和 WinBUGS,苏毓松开发的 R2jags 包 (Su and Yajima 2020) 是 JAGS 的 R 接口。

TMB

参考文献

Kutner, Michael H., Christopher J. Nachtsheim, John Neter, and William Li. 2005. Applied Linear Statistical Models. Fifth. New York, NY: McGraw-Hill/Irwin.
Su, Yu-Sung, and Masanao Yajima. 2020. R2jags: Using r to Run JAGS. https://CRAN.R-project.org/package=R2jags.
Young, Derek S. 2017. Handbook of Regression Methods. Boca Raton, FL: Chapman; Hall/CRC.