7.3 热图

Zuguang Gu 开发的 ComplexHeatmap 包实现复杂数据的可视化,用以发现关联数据集之间的模式。特别地,比如基因数据、生存数据等,更多应用见开发者的书籍 ComplexHeatmap 完全手册 。 R 包发布在 Bioconductor 上 https://www.bioconductor.org/packages/ComplexHeatmap。使用之前我要确保已经安装 BiocManager 包,这个包负责管理 Bioconductor 上所有的包,需要先安装它,然后安装 ComplexHeatmap(Gu, Eils, and Schlesner 2016)

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("ComplexHeatmap")

参考文献

Gu, Zuguang, Roland Eils, and Matthias Schlesner. 2016. “Complex Heatmaps Reveal Patterns and Correlations in Multidimensional Genomic Data.” Bioinformatics.